| 年 月 | できごと |
|---|---|
| 明治32年7月 | 京都帝国大学医科大学を設置 |
| 明治32年12月 | 京都帝国大学医科大学附属医院を開設・診療開始 |
| 大正8年2月 | 京都帝国大学医学部附属医院と改称 |
| 昭和24年5月 | 京都大学医学部附属病院と改称 |
| 平成10年4月 | 胸部疾患研究所附属病院（160床）を統合 |
| 平成16年4月 | 国立大学法人化 |
詳細な年表はこちらからご覧いただけます。
| No | 氏 名 | 任 期 |
|---|---|---|
| 初代 | 猪子止戈之助 | 明治32.7.6～明治34.2.8 |
| 第2代 | 伊藤隼三 | 明治34.2.8～大正4.7.2 |
| 第3代 | 中西亀太郎 | 大正4.7.2～大正5.7.21 |
| 第4代 | 松浦有志太郎 | 大正5.7.21～大正7.10.30 |
| 第5代 | 和辻春次 | 大正7.10.30～大正12.11.16 |
| 第6代 | 市川清 | 大正12.11.16～大正14.12.8 |
| 第7代 | 今村新吉 | 大正14.12.8～昭和3.4.25 |
| 第8代 | 松尾巖 | 昭和3.4.25～昭和7.5.13 |
| 第9代 | 岡林秀一 | 昭和7.5.13～昭和11.5.19 |
| 第10代 | 星野貞次 | 昭和11.5.19～昭和12.12.22 |
| 第11代 | 盛 新之助 | 昭和12.12.22～昭和16.12.22 |
| 第12代 | 服部峻治郎 | 昭和16.12.22～昭和20.12.22 |
| 第13代 | 三浦百重 | 昭和20.12.22～昭和23.12.22 |
| 第14代 | 菊池武彦 | 昭和23.12.22～昭和24.5.27 |
| 第15代 | 服部峻治郎 | 昭和24.5.27～昭和24.12.31 |
| 第16代 | 井上硬 | 昭和24.12.31～昭和28.12.31 |
| 第17代 | 三浦百重 | 昭和28.12.31～昭和29.10.20 |
| 第18代 | 山本俊平 | 昭和29.10.20～昭和32.12.16 |
| 第19代 | 後藤光治 | 昭和32.12.16～昭和36.12.15 |
| 第20代 | 近藤鋭矢 | 昭和36.12.16～昭和38.1.15 |
| 第21代 | 三宅儀 | 昭和38.1.16～昭和40.1.15 |
| 第22代 | 淺山亮二 | 昭和40.1.16～昭和43.3.31 |
| 第23代 | 福田正 | 昭和43.4.1～昭和43.7.31 |
| 第24代 | 木村忠司 | 昭和43.8.1～昭和45.7.31 |
| 第25代 | 太藤重夫 | 昭和45.8.1～昭和47.7.31 |
| 第26代 | 森本正紀 | 昭和47.8.1～昭和51.4.1 |
| 第27代 | 西村敏雄 | 昭和51.4.2～昭和55.4.1 |
| 第28代 | 塚原勇 | 昭和55.4.2～昭和59.4.1 |
| 第29代 | 半田肇 | 昭和59.4.2～昭和61.3.31 |
| 第30代 | 内野治人 | 昭和61.4.1～昭和62.3.31 |
| 第31代 | 戸部隆吉 | 昭和62.4.1～平成1.3.31 |
| 第32代 | 河合忠一 | 平成1.4.1～平成3.3.31 |
| 第33代 | 山室隆夫 | 平成3.4.1～平成5.3.31 |
| 第34代 | 吉田修 | 平成5.4.1～平成9.3.31 |
| 第35代 | 本田孔士 | 平成9.4.1～平成13.3.31 |
| 第36代 | 田中紘一 | 平成13.4.1～平成17.3.31 |
| 第37代 | 内山卓 | 平成17.4.1～平成20.3.31 |
| 第38代 | 中村孝志 | 平成20.4.1～平成23.3.30 |
| 第39代 | 三嶋理晃 | 平成23.4.1～平成27.3.31 |
| 第40代 | 稲垣暢也 | 平成27.4.1～平成31.3.31 |
| 第41代 | 宮本享 | 平成31.4.1～令和5.3.31 |
| 第42代 | 髙折晃史 | 令和5.4.1～ |
